「怪奇現象Xファイル」は、自然界で発生した奇妙な事象を調査する。
画期的な最新の科学と「誰の仕業か?」という興味深い観点に基づいたストーリー展開で、毎回3つの自然界における謎を解明。
ドイツの爆発するヒキガエル、スウェーデンの酔っ払ったヘラジカ、インドで降る赤い雨、オーストラリアのネズミの異常発生や盲目のカンガルーなどの怪奇現象が、番組の科学者チームと世界中の専門家たちにより献身的かつ入念に、ひとつひとつ解明されていく。